茂谷柑放冷庫能保鮮100~110天左右。為了保證冷庫的保鮮效果，冷庫溫度設置在2至5度為宜，冷庫相對濕度控制在85%至90%。

在儲存茂谷柑過程中，一定要保證庫內溫度、濕度穩定。因為溫度波動過大或溫度低，茂谷柑口味會變酸，品質會下降；溫度過高，呼吸作用加強，代謝會加快，會快速消耗糖分及營養。此外，茂谷柑在放入冷庫前，要有一個冷卻過程（即預冷）。預冷的溫度建議控制在4~6℃，預冷24小時后降便可入庫貯藏。

想要冷庫達到預期內的保鮮效果，茂谷柑在冷庫儲存期間的管理也十分重要。冷庫須每隔2周檢查茂谷柑的硬度、可溶性固形物、色、香、味等指標，并且要定期進行通風換氣，防止庫內空氣污濁，保持冷庫空氣清新潔凈。此外，茂谷柑存放之處與地面之間，必須放置冷庫專用墊板，確保底部貨物通風，通風情況好的話它的保鮮時間會更長一些。

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